Afin d'avoir un temps d'exécution correct le programme de comptage a été implémenté en C (figure \ref{comptage}).

\lstset{
	language=C,
	morecomment=[l][keywordstyle]{@\#},
	keywordstyle=\bfseries\ttfamily\color[rgb]{0,0,1},
	identifierstyle=\ttfamily,
	commentstyle=\color[rgb]{0.133,0.545,0.133},
	stringstyle=\ttfamily\color[rgb]{0.627,0.126,0.941},
	showstringspaces=false,
	basicstyle=\small,
	numberstyle=\footnotesize,
	numbers=left,
	stepnumber=1,
	numbersep=8pt,
	tabsize=2,
	breaklines=true,
	prebreak = \raisebox{0ex}[0ex][0ex]{\ensuremath{\hookleftarrow}},
	breakatwhitespace=false,
	aboveskip={1.5\baselineskip},
  columns=fixed,
  upquote=true,
  extendedchars=true,
  frame=single,
% backgroundcolor=\color{
}

\begin{figure}[H]
  

\begin{lstlisting}[numbers=left][caption=test]
      //
      void compte(char *seq, char *kmer,int **tab_resultat)
      {
        
      }
      // Pour chaque sequence
      for(i = 0 ; i < nb_sequence ; i++)
      {
        //Pour chaque k-mer
        for(j = 0 ; j < nb_kmer ; j++)
        {
          compte(tab_seq[i],tab_kmer[j],tab_resulat);
        }
      }
      
      //
      imprimer(tab_resultat,fichier_sortie);
                                                                     
\end{lstlisting}
\caption{\label{comptage} Code C simplifié pour le comptage de k-mer}
\end{figure}
~\\
